Forschungsgruppe von Jan BaumbachUnter der Führung von Dr. Jan Baumbach wurde am MPI die Forschungsgruppe Computational Systems Biology eingerichtet. Erforschen will man die Systembiologie, evolutionäre Sequenz- und Netzwerkanalyse, graphbasierte Analyse und Modellierung biologischer Netzwerke, Sequenz-Clustering, die Entdeckung von Sequenzmotiven, sowie Metabolomics. Neue Forschungsgruppen im ZBI?Im vergangenen Jahr hat das Zentrum für Bioinformatik zwei seiner drei Nachwuchs-Forschungsgruppen verloren: Dr. Dirk Neumann von der Gruppe “Drug Transport” ist in die Industrie gegangen um für die Bioskin AG Berlin zum Schwerpunkt “Dermale Absorption” zu forschen. Der ehemalige Leiter der Gruppe “Theoretical & Computational Membrane Biology”Prof. Dr. Rainer Böckmann ist einem Ruf an die Universität Erlangen-Nürnberg gefolgt und leitet dort nun den Lehrstuhl “Computational Biology”. Nun gibt es wohl eine fest geplante neue Forschungsgruppe und es laufen Verhandlungen zu einer weiteren. Saarbrücker Bioinformatik auf der CeBITDiese Woche findet in Hannover die alljährliche Computermesse CeBIT statt. Dort vertreten sind auch Mitarbeiter der Informatik der Saarland-Universität, u.a. einige Mitglieder des Zentrums für Bioinformatik (ZBI). Dr. Andreas Hildebrandt und Anna Katharina Dehof, M.Sc., stellen dort BALLView vor. BALLView ist eine Open Source Software zur Visualisierung von Proteinen. Ganz neu ist die Möglichkeit Proteine in 3D zu betrachten. Ermöglicht wird dies durch die Integration von Ray-Tracing-Algorithmen. Hier zeigt sich mal wieder eine Seite der Bioinformatik, die mich immer besonders fasziniert hat: Hier einige Beispiele:
Modern Methods in Drug DiscoveryDozent: PD Dr. Michael Hutter Da ich in diesem Semester meine Bachelorarbeit geschrieben habe, blieb nicht viel Zeit für weitere Veranstaltungen. Ich habe mich dann ausschließlich für diese Vorlesung entschieden. Gute und schlechte Gründe Dabei gab es zwei Gründe für meine Wahl. Der gute: Das Thema klingt interessant. Der “schlechte” Grund: Der scheinbar weniger gute Grund ist meiner Meinung nach gar nicht so schlecht. Format: Standard-Spezialvorlesung Die Vorlesung bringt nach den aktuellen Studienordnungen 5 Credit Points. Sie umfasst 2 Stunden Vorlesung (auf Englisch) pro Woche, alle zwei Wochen wird ein Tutorial angeboten, in dem vor allem die Aufgaben der insgesamt 6 Übungsblätter besprochen werden. Die Übungsblätter müssen allein bearbeitet werden und können persönlich oder per eMail abgegeben werden. Es sind je 100 Punkte zu erreichen. Zur Klausurzulassung sind 50% der erreichbaren Gesamtpunkte notwendig. Die Übungen sind nicht schwierig, man sollte lediglich die vorhergehenden Vorlesungen gehört oder die im Internet abrufbaren Folien durchgelesen haben. Es ist also ein Leichtes, zur Klausur zugelassen zu werden. Zuverlässige Klausurvorbereitung Dennoch lohnt es sich, mehr als 50% der Übungsaufgaben zu bearbeiten: Wer also sichere 5 Punkte für seinen Bachelor- oder Masterabschluss braucht, ist in dieser Vorlesung gut aufgehoben. Es ist jedoch auch wieder nicht so, dass man dabei nichts lernen würde. Zuvor hatte ich z.B. noch nie von SMILES und SMARTS gehört, und heute beherrsche ich sie aus dem Effeff. Studiengebühren im Saarland abgeschafftEndlich ist es so weit! Der saarländische Landtag hat in seiner Sitzung vom 10. Februar die Studiengebühren für das Erststudium abgeschafft. Somit besteht jetzt auch die bisher noch fehlende Rechtssicherheit, nachdem die Hochschulen bislang nur “vorläufig” keine Gebühren eingezogen hatten. Gebührenfrei studieren ab Sommer 2010Heute hat der Saarbrücker Landtag einen Gesetzesentwurf durchgewinkt, der die Abschaffung der Studiengebühren zum Sommersemester 2010 vorsieht. Damit hat die Jamaika-Koalition dieses Versprechen ihres Koalitionsvertrags eingehalten. Wenn im Januar die Rückmeldefrist beginnt, sind also nur noch die Kosten für den Semesterbeitrag zu entrichten. Eine enorme Erleichterung für die sowieso schon geplagten Bachelor- und Masterstudenten! Die Einnahmen, die den Hochschulen im Sommer deswegen entgehen, will das Land in voller Höhe erstatten. Allerdings soll ein entsprechendes Gesetz erst später beschlossen werden. Leibniz-Preis für Professor Joachim WeickertEiner der 10 Leibniz-Preisträger 2010 ist Prof. Dr. Weickert. Das wurde heute von der DFG bekanntgegeben. Der Professor für Mathematik und Informatik wird für seine Forschung im Bereich der Bildverarbeitung ausgezeichnet. Die Auszeichnung bringt außer Ruhm und Ehre auch ein hoch dotiertes Preisgeld mit sich: Ich freue mich für Prof. Weickert, der auch außerhalb der Forschung sehr engagiert ist. Für seinen Einsatz im Bereich der Lehre hat er bereits mehrmals von Studenten vergebene Auszeichnungen für seine Vorlesungen erhalten:
[Update] Es regnet, es regnet, die Informatiker werden nass.Vor kurzem hatte ich hier das undichte Dach des Informatikgebäudes angesprochen. Es regnet, es regnet, die Informatiker werden nass.Es verwundert doch ein wenig, dass auf dem Campus seit einiger Zeit an etlichen Stellen neue Gebäude errichtet werden, während die Sanierung älterer Gebäude wesentlich zögerlicher angegangen wird. Das Mathematik-Institutsgebäude hat mittlerweile zwar neue Fenster erhalten, aber das Dach des Eingangsbereichs des Informatikgebäudes ist immer noch undicht. Ich will mir gar nicht ausmalen, wie dieses Bild auf Besucher wirken mag, für die dieser Durchgang das erste ist, was sie von der Uni wahrnehmen… Offenbar hat jedoch die Universität des Saarlandes nicht als einzige einen gewissen Bedarf an zu Regentonnen umfunktionierten Mülleimern. Die Bioinformatik der Saarbrücker Uni zieht umNach dreijähriger Bauzeit und millionenschwerer Überschreitung der kalkulierten Kosten sind nun endlich alle 3 neuen Bioinformatik-Gebäude bezugsbereit: Die Bibliothek ist nun zentraler Standort für die gesamte Mathematik und Informatik der Universität sowie der Bestände des DFKI und der beiden Max-Planck-Institute. Die Bibliothek war als erstes der Gebäude fertig geworden. Sie ist wesentlich größer, als die alte Informatik-Bibliothek und bietet viel Raum zum Lesen und Lernen. Im neuen Institutsgebäude ziehen gerade Wissenschaftler der Informatik und Bioinformatik ein, so z.B. das gesamte Zentrum für Bioinformatik. Dadurch kann es vorübergehend zu Problemen bei der Erreichbarkeit der betreffenden Leute und natürlich auch der Server kommen. Für die Studenten ist sicherlich der neue Hörsaal am wichtigsten.
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